Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacnb3P54285 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms