Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PctpP53808 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PctpP53808 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PctpP53808 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PctpP53808 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PctpP53808 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PctpP53808 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms