Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms