Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ClgnP52194 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms