Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApodP51910 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApodP51910 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApodP51910 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApodP51910 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms