Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec1P51908 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms