Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccr5P51682 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr5P51682 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms