Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs12P50716 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs12P50716 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms