Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc13P50207 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms