Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Tmod1P49813 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tmod1P49813 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tmod1P49813 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Tmod1P49813 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmod1P49813 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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Tmod1P49813 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tmod1P49813 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod1P49813 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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