Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp3P49194 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms