Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms