Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgfaP48030 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TgfaP48030 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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