Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms