Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SrprbP47758 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SrprbP47758 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms