Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf4P43488 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms