Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-2P42580 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-2P42580 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms