Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppm1bP36993 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppm1bP36993 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms