Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sftpa1P35242 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms