Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptk2P34152 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptk2P34152 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms