Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pola1P33609 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pola1P33609 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pola1P33609 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pola1P33609 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms