Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc11P31313 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc11P31313 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms