Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctnnd1P30999 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnd1P30999 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms