Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tacr1P30548 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms