Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtgfP29268 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtgfP29268 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms