Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprmP28828 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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