Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RxraP28700 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RxraP28700 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RxraP28700 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RxraP28700 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RxraP28700 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RxraP28700 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RxraP28700 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RxraP28700 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RxraP28700 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RxraP28700 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms