Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpbP27790 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpbP27790 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms