Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabrg3P27681 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrg3P27681 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms