Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpbP27048 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms