Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChgaP26339 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChgaP26339 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChgaP26339 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ChgaP26339 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChgaP26339 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms