Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PparaP23204 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PparaP23204 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PparaP23204 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PparaP23204 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PparaP23204 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PparaP23204 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PparaP23204 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PparaP23204 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PparaP23204 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PparaP23204 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PparaP23204 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms