Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cd3eP22646 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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