Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmnb2P21619 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmnb2P21619 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms