Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim1P20664 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms