Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a2P20490 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms