Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcer1aP20489 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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