Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TP20293 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TP20293 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TP20293 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TP20293 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TP20293 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TP20293 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms