Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PdgfaP20033 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms