Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NefhP19246 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NefhP19246 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NefhP19246 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NefhP19246 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NefhP19246 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms