Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms