Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms