Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrkceP16054 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrkceP16054 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrkceP16054 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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