Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf271P15620 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf271P15620 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms