Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp54P14576 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp54P14576 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms