Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntn1P12960 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn1P12960 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms