Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrm1P12657 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrm1P12657 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms