Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MdkP12025 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MdkP12025 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MdkP12025 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MdkP12025 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MdkP12025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MdkP12025 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms