Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PolP11369 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PolP11369 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PolP11369 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PolP11369 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PolP11369 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms