Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P10404 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P10404 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P10404 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P10404 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P10404 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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